Οι κοιλίες του εγκεφάλου είναι τέσσερις θάλαμοι γεμάτοι με υγρό στον ανθρώπινο εγκέφαλο που βοηθούν στην προστασία του εγκεφάλου από εξωτερικά τραύματα. Οι κοιλίες του εγκεφάλου λειτουργούν επίσης ως δεξαμενές για το εγκεφαλονωτιαίο υγρό (ΕΝΥ), μια ουσία σημαντική για τη μεταφορά ορμονών, εκκριτικών προϊόντων, τοξινών και μεταβολιτών σε όλο τον εγκέφαλο. Οι μεγαλύτερες κοιλίες είναι οι δύο πλευρικές κοιλίες, οι οποίες βρίσκονται κάτω από τα εγκεφαλικά ημισφαίρια του εγκεφάλου – μία στη δεξιά πλευρά και μία στην αριστερή. Η τρίτη κοιλία βρίσκεται στην περιοχή του εγκεφάλου που ονομάζεται διενέργεια και η τέταρτη κοιλία βρίσκεται στο στέλεχος του εγκεφάλου.
Οι τέσσερις κοιλίες του εγκεφάλου είναι όλες συνδεδεμένες και το ΕΝΥ μπορεί να ρέει μεταξύ τους. Οι πλευρικές κοιλίες συνδέονται μέσω του μεσοκοιλιακού τρήματος, το οποίο είναι επίσης γνωστό ως το τρήμα της Μονρόε. Το υγρό μπορεί να ρέει από την τρίτη κοιλία στην τέταρτη κοιλία μέσω του εγκεφαλικού υδραγωγείου, γνωστό και ως υδραγωγείο του Sylvius. Το ΕΝΥ που βγαίνει από την τέταρτη κοιλία φεύγει μέσω του τρήματος του Λούσκα και του Μαγκέντι. Από εκεί το ΕΝΥ μπορεί να εισέλθει στο κεντρικό κανάλι του νωτιαίου μυελού.
Οι κοιλίες του εγκεφάλου βρίσκονται ανάμεσα σε δύο ξεχωριστές μεμβράνες, οι οποίες ονομάζονται μηνίγγες. Η μεμβράνη που βρίσκεται πιο κοντά στην επιφάνεια του εγκεφάλου είναι η pia mater. Αυτή η λεπτή, ημιδιαφανής μεμβράνη προσκολλάται στις καμπύλες της επιφάνειας του εγκεφάλου. Το ΕΝΥ που γεμίζει τις κοιλίες βρίσκεται πάνω από την πια ματέρα αλλά κάτω από το αραχνοειδές στρώμα. Εξωτερικά στις μεμβράνες πια και αραχνοειδούς βρίσκεται η σκληρή μήτρα, η οποία είναι μια άκαμπτη θήκη που περικλείει όλο το υλικό του εγκεφάλου.
Όλες οι κοιλίες του εγκεφάλου περιέχουν ΕΝΥ. Αυτό το υγρό είναι σημαντικό ως πηγή διατροφής για τις δομές του εγκεφάλου και ως τρόπος απομάκρυνσης των αποβλήτων. Το CSF χρησιμεύει επίσης ως μαξιλάρι που προστατεύει κρίσιμα μέρη του εγκεφάλου από εξωτερική πίεση, όπως ένα χτύπημα στο κεφάλι. Τα κύρια συστατικά του ΕΝΥ περιλαμβάνουν νερό, λιγότερο από 50 χιλιοστόγραμμα ανά δεκατόλιτρο πρωτεΐνης, από 50 έως 75 χιλιοστόγραμμα ανά δεκατόλιτρο γλυκόζης και από μηδέν έως πέντε κύτταρα αίματος ανά μικρολίτρο. Το υγιές ΕΝΥ είναι διαυγές και άχρωμο.
Το ΕΝΥ δεν γεμίζει μόνο τις κοιλίες του εγκεφάλου αλλά περιβάλλει και τον εγκέφαλο και το νωτιαίο μυελό. Γεμίζει το χώρο μεταξύ της αραχνοειδούς μεμβράνης και της pia mater, των μεμβρανών που καλύπτουν τον εγκέφαλο και τον νωτιαίο μυελό. Επομένως, το ΕΝΥ βρίσκεται μέσα στον εγκέφαλο, περιβάλλει τον εγκέφαλο, γύρω από την παρεγκεφαλίδα και περικλείει το μήκος του νωτιαίου μυελού.
Το ΕΝΥ γεμίζει τις κοιλίες του εγκεφάλου σύμφωνα με ένα συγκεκριμένο μοτίβο ροής. Παράγεται από ιστό που ονομάζεται χοριοειδές πλέγμα. αυτή η ουσία μπορεί να βρεθεί σε όλες τις κοιλίες εκτός από ορισμένα τμήματα των πλευρικών κοιλιών. Αφού σχηματιστεί από το χοριοειδές πλέγμα, το ΕΝΥ κυκλοφορεί σε όλες τις κοιλίες και στο νωτιαίο μυελό. Τελικά απορροφάται ξανά από αραχνοειδείς κοκκοποιήσεις, οι οποίες είναι δομές που βρίσκονται μεταξύ της πια υφής και της αραχνοειδούς μεμβράνης στην ανώτερη όψη των εγκεφαλικών ημισφαιρίων. Οι αραχνοειδείς κόκκοι τροφοδοτούν το ΕΝΥ στο φλεβικό σύστημα.