Υπάρχουν πολλές πιθανές αιτίες ενός ακανόνιστου εμμηνορροϊκού κύκλου. Ορισμένα από αυτά είναι εντελώς καλοήθη και άλλα υποδηλώνουν την ανάγκη θεραπείας. Η θεραπεία μπορεί να περιλαμβάνει μέτρα αυτοεξυπηρέτησης όπως η μείωση του στρες, η υγιεινή διατροφή και η τροποποίηση της άσκησης. Οι ιατρικές θεραπείες θα μπορούσαν να αντιμετωπίσουν ορμονικές ανωμαλίες που μπορεί να προκαλούν ακανόνιστο εμμηνορροϊκό κύκλο.
Ο ακανόνιστος εμμηνορροϊκός κύκλος ορίζεται έναντι αυτού που θεωρείται φυσιολογικό. Οι κανονικοί κύκλοι για τα δύο πρώτα χρόνια μετά την πρώτη έμμηνο ρύση ορίζονται ως 21-45 ημέρες και μετά από αυτό το διάστημα, ο κανονικός κύκλος είναι 21-35 ημέρες. Είναι επίσης φυσιολογικό για όλες τις γυναίκες να έχουν περιστασιακά χαμένη περίοδο ή πρόωρη ή καθυστερημένη περίοδο, και ένας ακανόνιστος εμμηνορροϊκός κύκλος θεωρείται ένα σταθερό μοτίβο μη φυσιολογικών χρονικών περιόδων. Μία μόνο απώλεια περιόδου σε όλες τις σεξουαλικά ενεργές γυναίκες δεν πρέπει να αγνοηθεί, επειδή μπορεί να οφείλεται σε εγκυμοσύνη.
Γενικά, δεν υπάρχει θεραπεία για ακανόνιστο εμμηνορροϊκό κύκλο για κορίτσια με νέα εμμηνόρροια, επειδή οι κύκλοι μπορεί να παρουσιάζουν διακυμάνσεις. Τα δύο πρώτα χρόνια, οι περίοδοι τείνουν να ρυθμίζονται και να έρχονται σε πιο τακτικό χρόνο κάθε μήνα. Συνήθως δεν έχουν μεγαλύτερη από 35 ημέρες διαφορά. Οι κύκλοι γίνονται αναμενόμενα μη φυσιολογικοί και πάλι κατά την περιεμμηνόπαυση, η οποία μπορεί να συμβεί ήδη από τα τέλη της δεκαετίας του ’30 και διαρκεί μέχρι την εμμηνόπαυση.
Είναι δύσκολο να καθοριστούν θεραπείες για έναν ακανόνιστο έμμηνο κύκλο λόγω του μεγάλου αριθμού αιτιολογικών παραγόντων. Οι γυναίκες που αντιμετωπίζουν τακτικά ακανόνιστες περιόδους μπορεί να θέλουν να πάνε πρώτα τις ανησυχίες τους σε έναν γυναικολόγο. Εάν δεν υπάρχουν ενδείξεις ιατρικής αιτίας, όπως ορμονική ανισορροπία, υποψία για διατροφικές διαταραχές ή πιθανά σεξουαλικά μεταδιδόμενα νοσήματα (ΣΜΝ), τα προκαταρκτικά βήματα για τη θεραπεία της πάθησης θα μπορούσαν να είναι συμβουλές για μείωση του στρες ή αλλαγή διατροφικών συνηθειών.
Σε ορισμένους πληθυσμούς, όπως στην πρώιμη και όψιμη εφηβεία, οι γιατροί μπορεί να αναζητήσουν ορισμένα ζητήματα. Καταστάσεις όπως η ανορεξία ή η βουλιμία μπορεί να δημιουργήσουν έναν συνεχή ακανόνιστο εμμηνορροϊκό κύκλο. Τα σεξουαλικά μεταδιδόμενα νοσήματα μπορούν επίσης να προκαλέσουν αυτό το πρόβλημα. Οι ανταγωνιστικοί αθλητές στην εφηβεία τους μπορεί να παρουσιάσουν πλήρη διακοπή των περιόδων (αμηνόρροια) ή ανωμαλία. Η θεραπεία εξαρτάται από την αιτία. Η ανταγωνιστική αθλήτρια δεν χρειάζεται θεραπεία, αλλά θα μπορούσε να μειώσει τη δραστηριότητά της εάν θέλει να ξαναρχίσουν οι περίοδοι της, αλλά αυτά τα άλλα ζητήματα απαιτούν περισσότερη ιατρική παρέμβαση.
Μερικές φορές οι ορμονικές ανισορροπίες παίζουν ρόλο στον ακανόνιστο έμμηνο κύκλο. Αυτές οι ανισορροπίες θα μπορούσαν να προκληθούν από πάρα πολλές ή πολύ λίγες ορμόνες όπως τα οιστρογόνα ή υπερβολική τεστοστερόνη, τις οποίες οι γυναίκες συνήθως παράγουν σε πολύ μικρές ποσότητες. Πρόσθετες ορμόνες που μπορεί να ρυθμίζουν την παραγωγή γυναικείων και ανδρικών ορμονών περιλαμβάνουν θυρεοειδικές ορμόνες. Ο υποθυρεοειδισμός ή ο υπερθυρεοειδισμός μπορεί να επηρεάσει τους μηνιαίους κύκλους.
Η συμπλήρωση κατάλληλων ορμονών μπορεί να αντιμετωπίσει αυτές τις ανισορροπίες και να δημιουργήσει πιο τακτικούς κύκλους. Ορμονική θεραπεία μπορεί επίσης να συνταγογραφηθεί για τη ρύθμιση των απολύτως φυσιολογικών αποκλίσεων του κύκλου που αρχίζουν να συμβαίνουν κατά την εμμηνόπαυση. Συνήθως η ορμονική θεραπεία χρησιμοποιείται για την αύξηση της γονιμότητας, ως έλεγχος των γεννήσεων ή για τη μείωση των συμπτωμάτων της εμμηνόπαυσης. Η θεραπεία δεν είναι συνήθως απαραίτητη για ακανόνιστους κύκλους, εκτός εάν προκαλούν άλλες ανησυχίες.