Βρίσκεται στο μεταιχμιακό σύστημα του εγκεφάλου, η αμυγδαλή είναι μια εγκεφαλική δομή που εμπλέκεται στην επεξεργασία των συναισθηματικών ερεθισμάτων, καθώς και στη δέσμευσή τους στη μνήμη. Η βλάβη στην αμυγδαλή μπορεί να έχει πολλά διαφορετικά αποτελέσματα, συμπεριλαμβανομένης της αδυναμίας δημιουργίας ή εκτέλεσης αντιδράσεων φόβου σε συγκεκριμένα ερεθίσματα. Τα αποτελέσματα μπορεί επίσης να περιλαμβάνουν μειωμένες εκφράσεις μητρικής συμπεριφοράς. Επικίνδυνες συμπεριφορές όπως ο τζόγος με κακές πιθανότητες μπορεί επίσης να αυξηθούν μετά από βλάβη σε αυτή την περιοχή του εγκεφάλου.
Κανονικά, η αμυγδαλή βοηθά τον εγκέφαλο να κωδικοποιήσει και να εκφράσει τις αντιδράσεις του φόβου. Μετά την έκθεση σε απειλητικά ερεθίσματα, ο εγκέφαλος απομνημονεύει αυτές τις καταστάσεις και η επανεμφάνιση του ερεθίσματος θα προκαλέσει μια αντίδραση φόβου. Κάποια ζημιά θα σβήσει εντελώς αυτή την απόκριση. Ένα άτομο με αυτή τη βλάβη δεν θα συσχετίσει τις αντιδράσεις του φόβου με ερεθίσματα. Οι προηγουμένως αποκτηθείσες αντιδράσεις φόβου δεν θα εκφραστούν με την παρουσία ερεθισμάτων.
Συναισθήματα εκτός του φόβου διαμεσολαβούνται σε αυτόν τον τομέα. Σε μελέτες που αφορούσαν πιθήκους, η βλάβη στην αμυγδαλή έκανε τις μητέρες να σταματήσουν να εμφανίζουν μητρική συμπεριφορά. Αντίθετα, οι μητέρες επιτέθηκαν ή κακοποίησαν τα μωρά τους, σε ορισμένες περιπτώσεις. Οι βλάβες σε ολόκληρη την αμυγδαλή και στις δύο πλευρές του εγκεφάλου οδήγησαν στο σύνδρομο Kluver-Bucy σε πιθήκους. Αυτή η διαταραχή προκαλεί έλλειψη επιθετικότητας και φόβου, καθώς και ακατάλληλη σεξουαλική συμπεριφορά.
Η βοήθεια των ατόμων να αναγνωρίσουν τα συναισθήματα είναι μια άλλη λειτουργία που μπορεί να επηρεαστεί από τη ζημιά. Τα άτομα που είχαν βλάβη στην αμυγδαλή και στις δύο πλευρές του εγκεφάλου δεν ήταν σε θέση να αναγνωρίσουν συναισθήματα που σχετίζονται με τις εκφράσεις του προσώπου. Μερικές φορές, μπέρδευαν ακόμη και τις εκφράσεις του θυμού με το χαμόγελο. Όταν σε αυτά τα άτομα έδειξαν συναισθηματικές εκφράσεις χωρίς πρόσωπα, μπορούσαν να αναγνωρίσουν το συναίσθημα που εμφανίστηκε. Αυτό το αποτέλεσμα δείχνει ότι ο εγκέφαλος έχει άλλα κέντρα που βοηθούν τα άτομα να αναγνωρίζουν τα συναισθήματα.
Η αποστροφή για την απώλεια είναι ένας όρος που περιγράφει την αποφυγή ανάληψης κινδύνων, ειδικά όταν αυτοί οι κίνδυνοι δεν θα οδηγούσαν σε σημαντικό κέρδος. Η βλάβη της αμυγδαλής στους ανθρώπους δημιούργησε μια αδυναμία εξάσκησης της αποστροφής για την απώλεια. Αυτοί οι άνθρωποι έτειναν να αναλαμβάνουν μεγάλους κινδύνους στον τζόγο, ακόμη και όταν δεν κέρδιζαν πολλά χρήματα από τη νίκη. Η ανάληψη κινδύνου που δεν είχε τη δυνατότητα το άτομο να χάσει κάτι δεν επηρεάστηκε.
Η ανίχνευση άλλων ανθρώπων στον προσωπικό χώρο κάποιου είναι μια άλλη λειτουργία της αμυγδαλής που μπορεί να επηρεαστεί. Όταν η αμυγδαλή είναι κατεστραμμένη και στις δύο πλευρές του εγκεφάλου, οι άνθρωποι δεν αντιδρούν στους άλλους που στέκονται στον προσωπικό τους χώρο. Αυτό το αποτέλεσμα μπορεί να οφείλεται στο ότι τα άτομα δεν κάνουν διάκριση μεταξύ του να στέκονται ακριβώς δίπλα σε κάποιον και να στέκονται σε κάποια απόσταση από αυτόν.