Δεδομένου ότι το ψάρι θεωρείται εξαιρετικά υγιεινό και ωφέλιμο κρέας, πολλοί καταναλωτές ενθαρρύνονται να το κάνουν μεγαλύτερο μέρος της διατροφής τους. Η αυξημένη ζήτηση για ψάρια έχει οδηγήσει σε υπεραλίευση πολλών πληθυσμών άγριων ψαριών. Ως απάντηση, δημιουργήθηκαν ιχθυοτροφεία, τα οποία εκτρέφουν ψάρια σε κλειστούς χώρους με δίχτυ. Τα εκτρεφόμενα ψάρια θα μπορούσαν να θεωρηθούν ως μια βιώσιμη απάντηση στην υπεραλίευση, αλλά δυστυχώς, τα εκτρεφόμενα ψάρια μπορεί να μην είναι τόσο φιλικά προς το περιβάλλον όσο φαίνεται. Μια παγκόσμια συζήτηση μαίνεται για τα εκτρεφόμενα ψάρια, γεγονός που καθιστά δύσκολο για τους καταναλωτές να κάνουν επιλογές που είναι ωφέλιμες για τα ψάρια, ενώ συμπεριλαμβάνουν και τα ψάρια στη διατροφή τους.
Υπάρχουν πολλά προβλήματα με τα εκτρεφόμενα ψάρια που τα καθιστούν κακή διατροφική επιλογή, με εξαίρεση ορισμένα είδη ψαριών και θαλασσινών. Τα οστρακοειδή όπως τα στρείδια, για παράδειγμα, καλλιεργούνται με επιτυχία εδώ και δεκαετίες, και η εκτροφή στρειδιών στην πραγματικότητα φαίνεται να ωφελεί το θαλάσσιο περιβάλλον. Ορισμένα είδη όπως η τιλάπια, ο οξύρρυγχος και το γατόψαρο εκτρέφονται συχνά με βιώσιμη και φιλική προς το περιβάλλον τρόπο.
Ωστόσο, οι άνθρωποι θα πρέπει να αποφεύγουν να αγοράζουν τα περισσότερα άλλα εκτρεφόμενα είδη ψαριών. Το πρώτο μέλημα είναι η ανθρώπινη υγεία. Τα ψάρια εκτροφής τρέφονται με φθηνή και τυποποιημένη διατροφή. Αυτό οδηγεί σε πολύ λιγότερη διατροφική διακύμανση από ό,τι θα λάμβαναν στη φύση, γεγονός που δημιουργεί λιγότερη θρεπτική αξία, ανά κιλό, από ό,τι τα άγρια ψάρια. Η διατροφή που δίνεται στα ψάρια εκτροφής είναι επίσης υψηλή σε λίπος και το λίπος συγκεντρώνει επιβλαβείς τοξίνες όπως τα PCB.
Η υγεία της αλιείας αποτελεί επίσης σημαντικό μέλημα για τα εκτρεφόμενα ψάρια. Πολλά εκτρεφόμενα ψάρια τρέφονται με ψάρια από την αλιεία της Νότιας Αμερικής, τα οποία εξαντλούνται γρήγορα ως αποτέλεσμα. Επιπλέον, τα μη ιθαγενή είδη που εκτρέφονται μπορούν να διαφύγουν, εις βάρος των ιθαγενών ειδών της περιοχής. Τα ψάρια εκτροφής μεταφέρουν επίσης ασθένειες και παράσιτα, επειδή φυλάσσονται σε σφιχτά συσκευασμένα μαντριά. Ενώ τα ψάρια εκτροφής είναι φορτωμένα με αντιβιοτικά, τα άγρια ψάρια στην περιοχή δεν είναι, και μπορούν και αρρωσταίνουν.
Το θαλάσσιο περιβάλλον επηρεάζεται επίσης σε μεγάλο βαθμό από τα εκτρεφόμενα ψάρια. Τα περισσότερα ψάρια τρώνε σχετικά αναποτελεσματικά, ρίχνουν το μεγαλύτερο μέρος της τροφής τους στον πυθμένα του ωκεανού και χωνεύουν μόνο ένα μικρό ποσοστό από αυτό που τρώνε. Όταν τα ψάρια διατηρούνται σε σταθερό περιβάλλον, αυτό οδηγεί σε ευτροφισμό, μια συγκεντρωμένη αύξηση των θρεπτικών συστατικών που τελικά οδηγεί σε μια νεκρή ζώνη. Τα εκτρεφόμενα ψάρια δημιουργούν επίσης άλλους τύπους ρύπανσης, που μπορεί να είναι δύσκολο να εξαλειφθούν, ακόμη και μετά την απομάκρυνση των εκτρεφόμενων ψαριών από την περιοχή.
Η αναζήτηση άγριων αλιευμένων ψαριών όπως ο μακρόστενος, ο κιτρινόπτερος τόνος, ο γαύρος, ο μπακαλιάρος, ο μπακαλιάρος του Ειρηνικού, οι καραβίδες, οι ιππόγλωσσες, οι σαρδέλες, το χόκι, το mahi-mahi και το σκουμπρί είναι ένας πολύ καλός τρόπος για την υποστήριξη της βιώσιμης αλιείας και των αλιευτικών πρακτικών. Θα πρέπει πάντα να αποφεύγονται ψάρια όπως η σφυρίδα, το πορτοκαλί, το λαβράκι της Χιλής, οι καρχαρίες, ο ερυθρός τόνος, ο ξιφίας και τα είδη με τράτα ή βυθοκόρηση, καθώς πολλά από αυτά τα είδη αλιείας έχουν υποστεί σοβαρή εξάντληση. Η τράτα και η βυθοκόρηση είναι επίσης πολύ κακές για το θαλάσσιο περιβάλλον. Ο αστακός, το καβούρι, η γλώσσα και το λυθρίνι θεωρούνται όλα αποδεκτά για κατανάλωση, αν και η αλιεία κινδυνεύει και οι καταναλωτές μπορεί να θέλουν να τα αποφύγουν.