Skutki uboczne białka serwatkowego są ogólnie uważane za minimalne, chociaż niektóre istnieją. Wiele związków zawartych w białku serwatkowym jest powszechnych w większości diet, chociaż wysoki poziom białka może powodować dyskomfort trawienny, nudności, problemy z nerkami i inne dolegliwości u niektórych osób. Dodatkowo u osób z nietolerancją laktozy mogą występować reakcje alergiczne. Osoby przyjmujące niektóre leki i antybiotyki mogą również zostać ostrzeżone przed przyjmowaniem białka serwatkowego.
W większości przypadków skutki uboczne białek serwatkowych nie są specyficzne dla samego produktu. Takie efekty wskazują raczej na ilość białka, wapnia, węglowodanów, laktozy lub innych związków i składników odżywczych znajdujących się w produkcie. Innymi słowy, większość składników, które powodują skutki uboczne lub interakcje, znajduje się w przeciętnych dietach.
Jak sama nazwa wskazuje, produkt zawiera wysoki poziom białka. Nadmiar białka może wywierać zbyt duży nacisk na nerki. Wyczerpuje również organizm w niektóre witaminy i minerały. Z tego powodu osoby stosujące diety wysokobiałkowe często przyjmują suplementy wielowitaminowe. Dieta wysokobiałkowa, stosowana przez osoby regularnie spożywające białko serwatkowe, może również podnosić kwasowość krwi, która powinna być utrzymywana jak najbliżej neutralnej (7.0 w skali pH).
Ci, którzy nie ćwiczą regularnie, mogą nie mieć powodu, aby spożywać białko serwatkowe, szczególnie w kulturze zachodniej, gdzie duże ilości białka są powszechne w przeciętnej diecie. Skutków ubocznych białka serwatkowego można uniknąć, przyjmując produkt tylko podczas próby budowania masy mięśniowej lub utraty wagi. Każda z tych korzyści będzie osiągana tylko wtedy, gdy towarzyszyć im będą ćwiczenia i ogólnie zdrowa dieta.
Niektóre skutki uboczne białek serwatkowych wynikają z ilości laktozy w produkcie, która zwykle jest bliska 5 lub 6 procent. Ponownie, jak sama nazwa wskazuje, białko serwatkowe pochodzi ze związku mleka zwanego serwatką, który jest oddzielany od skrzepu używanego w produkcji sera. Podstawowym cukrem znajdującym się w mleku i serwatce jest laktoza, której wiele osób nie toleruje. Nietolerancja laktozy może powodować dyskomfort i dolegliwości trawienne. Izolat białka serwatkowego, który zawiera mniej niż jeden procent cukru laktozy, jest dostępny dla osób cierpiących na nietolerancję laktozy.
Niewłaściwe dawkowanie może również powodować pewne skutki uboczne białek serwatkowych. Produkt jest ogólnie uważany za bezpieczny i korzystny, gdy jest przyjmowany w odpowiednich ilościach. Jednak przyjmowanie zbyt dużej ilości może powodować nudności, wzmożone wypróżnienia, zmęczenie i utratę apetytu.
Istnieją pewne interakcje między białkiem serwatkowym a niektórymi lekami na receptę lub antybiotykami. Na przykład ci, którzy przyjmują tetracykliny, mogą chcieć zachować ostrożność, ponieważ wysoki poziom wapnia w białku serwatkowym może hamować wchłanianie tetracyklin w żołądku. Problem ten można rozwiązać, unikając spożywania białka serwatkowego i tetracyklin w odstępie czterech godzin. Lekarz prawdopodobnie udzieli takich informacji, a wiele marek zamieści kompleksowe wskazania, ostrzeżenia i informacje żywieniowe na boku swoich produktów.