Pesto jest najlepsze, gdy jest przyrządzane świeże, a następnie podawane, jednak dla biegających kucharzy nie zawsze jest to możliwe. Istnieje wiele wskazówek dotyczących zamrażania pesto, z których wiele zależy w dużej mierze od ilości zamrożonego pesto. Ponieważ pesto nie należy rozmrażać, a następnie ponownie zamrażać, najlepiej jest dokładnie wiedzieć, ile będzie potrzebne po rozmrożeniu i po prostu zamrozić w ilościach zbliżonych do tej ilości. Ponieważ jest to ważne dla zachowania integralności smaku pesto, najlepiej jest zamrozić pesto w taki sposób, aby najskuteczniej uniknąć przypaleń zamrażalniczych.
Są tacy kucharze, którzy wolą robić duże porcje oleju, bazylii i sosu z orzeszków piniowych, a następnie zamrażać pesto w tackach na kostki lodu. Pozwala to na łatwe przygotowanie posiłku o dowolnej wielkości w krótkim czasie. Mrożenie pesto w tackach na kostki lodu pozwoli na szybkie rozmrożenie, a następnie podgrzanie dowolnej ilości, od kilku kostek do całej tacki. Aby uniknąć przypalenia w zamrażarce, po zamrożeniu pesto zamknij tackę w torbie przeznaczonej do zamrażania.
Podobnie jak w przypadku zamrażania pesto na tackach na kostki lodu, używa się form do muffin, aby je zamrozić. Po rozmrożeniu daje to kucharzowi porcję pesto o pojedynczej porcji. Zaleca się spryskanie formy do muffinek olejem spożywczym przed nałożeniem na nią świeżego pesto. Pomoże to w łatwym wyjęciu z puszki, gdy przyjdzie czas na rozmrożenie sosu. Ponownie, przy takim podejściu sugeruje się, aby puszkę zapieczętować po początkowym zamrożeniu pesto.
Torebki do zamrażania galonów tworzą optymalny pojemnik do przechowywania pesto w dużych ilościach. Gdy nadejdzie pora na rozmrożenie pesto, można je po prostu postawić na blacie kuchennym lub w zlewie w woreczku do zamrażania. Mrożone pesto można następnie pozostawić na czas, aby naturalnie osiągnęło temperaturę pokojową.
Mrożone pesto pozostanie dobre przez około cztery do sześciu miesięcy. Po tym czasie najlepiej go wyrzucić, gdyż smak nie będzie już optymalny. Zapisanie daty umieszczenia pesto w zamrażarce, czy to na taśmie maskującej, którą można umieścić na tacce na kostki lodu lub puszce do muffinek, czy też nieusuwalnym markerem na woreczku do zamrażarki, pomoże zapewnić, że pesto zostanie użyte, zanim się zepsuje.