Wielu rodziców ma wybredne dzieci i czasami obwiniają mleko modyfikowane dla niemowląt, powołując się na nietolerancję laktozy. Laktoza lub cukier mleczny jest jednak obecna w mleku matki, więc zwykle nie jest to przyczyną niepokoju dziecka. Niemniej jednak niektóre dzieci wymagają formuły bezlaktozowej, a mianowicie te, które mają galaktozemię, czyli niezdolność do trawienia laktozy. Innym powodem, dla którego rodzice tymczasowo przestawiają się na formułę bezlaktozową, jest walka z biegunką, która może powodować tymczasową nietolerancję laktozy. Różne rodzaje mleka modyfikowanego bez laktozy obejmują odmiany produkowane z mleka krowiego, z którego usunięto laktozę, sojowe lub hydrolizowane białka.
Jednym z rodzajów mleka modyfikowanego bez laktozy jest po prostu mleko krowie, z którego usunięto laktozę. Zazwyczaj zamiast laktozy do formuły dodaje się syrop kukurydziany i cukier stołowy, zwany sacharozą. Ten rodzaj mieszanki dla niemowląt może pomóc dzieciom, które nie trawią laktozy, tymczasowo lub na stałe, ale nie są odpowiednie dla niemowląt uczulonych na mleko krowie, ponieważ nadal zawierają białko mleka.
Dziecko, które nie toleruje mleka krowiego, może zostać przestawione na mieszankę sojową, która jest innym rodzajem mieszanki bezlaktozowej. Ten rodzaj mieszanki jest również odpowiedni dla rodzin wegańskich, które nie chcą, aby ich dzieci spożywały jakiekolwiek produkty pochodzenia zwierzęcego. Jednym z problemów związanych ze stosowaniem mieszanki sojowej u dziecka z alergią na mleko jest to, że wiele dzieci uczulonych na mleko jest również uczulonych na soję. Istnieją również spekulacje, że preparaty sojowe mogą powodować problemy ze wzrostem, szczególnie u niemowląt, które urodziły się bardzo małe lub przedwcześnie.
Dla niemowląt, które nie trawią laktozy lub soi, niektórzy pediatrzy zalecają mieszankę składającą się z hydrolizowanych lub wstępnie trawionych białek. Inne powody podawania hydrolizatów to częste wysypki, kolki lub inne objawy alergii. Te bezlaktozowe formuły są bardzo lekkostrawne dla alergików. Preparaty te są zazwyczaj dość drogie i mogą kosztować trzy razy więcej niż tradycyjne preparaty dla niemowląt na bazie mleka.
We wszystkich przypadkach rodzice powinni skonsultować się z pediatrą swojego dziecka przed podjęciem decyzji, jaką mieszanką podawać dziecku. Większość dzieci dobrze sobie radzi z mieszanką na bazie mleka krowiego. Nawet jeśli dziecko ma kolkę, niekoniecznie oznacza to, że dziecko nie toleruje laktozy lub że potrzebna jest mieszanka bezlaktozowa. Zmiana formuły może powodować dalsze zaburzenia trawienia, dlatego powinna odbywać się tylko pod nadzorem i radą lekarza.