Πολλοί διαφορετικοί παράγοντες μπορούν να επηρεάσουν τον μισθό ενός εμπορικού πιλότου, αν και το κύριο ζητούμενο είναι συνήθως η αρχαιότητα. Οι πιλότοι που έχουν πολλές ώρες πτήσης και έχουν πετάξει για την ίδια εταιρεία για πολλά χρόνια, τείνουν να κάνουν ουσιαστικά περισσότερους από πιλότους αρχικού επιπέδου. Ο μισθός εξαρτάται επίσης πολύ από το αν ο πιλότος είναι λοχαγός ή πρώτος αξιωματικός και άλλοι παράγοντες όπως η βιομηχανία στην οποία εργάζεται, τα δρομολόγια που εκτελούνται και ο αριθμός των ωρών εργασίας κάθε μήνα. Υπάρχουν πολλές διαφορετικές βιομηχανίες στις οποίες μπορεί να εργαστεί ένας εμπορικός πιλότος, καθένα από τα οποία προσφέρει διαφορετικά επίπεδα αμοιβής. Ο μισθός ενός εμπορικού πιλότου μπορεί να εξαρτηθεί ακόμη και από τη συγκεκριμένη εταιρεία στην οποία εργάζεται, καθώς διαφορετικές επιχειρήσεις στον ίδιο κλάδο έχουν συχνά σημαντικά διαφορετικές κλίμακες αμοιβών.
Οι εμπορικοί πιλότοι είναι άτομα με υψηλή κατάρτιση που έχουν εξουσιοδότηση να λαμβάνουν αμοιβή για πιλότο ή συγκυβέρνηση διαφόρων τύπων αεροσκαφών. Μια Άδεια Εμπορικού Πιλότου (CPL) ή η πιο προηγμένη Άδεια Χειριστή Αεροπορικών Μεταφορών (ATP) είναι συνήθως απαραίτητα για να έχετε αυτόν τον τύπο καριέρας. Υπάρχουν επίσης διαφορετικές αξιολογήσεις τύπου για αεροπλάνα, ελικόπτερα και άλλους τύπους αεροσκαφών που επιτρέπεται να πετάει ένας εμπορικός πιλότος. Δεδομένου ότι οι προοπτικές εργασίας ενός πιλότου επηρεάζονται από την άδεια και τις βαθμολογίες του, αυτές μπορεί να είναι σημαντικοί καθοριστικοί παράγοντες για τον μισθό ενός εμπορικού πιλότου.
Μεταξύ των πιλότων που έχουν παρόμοια διαπιστευτήρια και εργάζονται στον ίδιο κλάδο, ο μεγαλύτερος καθοριστικός παράγοντας για τον μισθό είναι η προϋπηρεσία. Οι ολοκαίνουριοι εμπορικοί πιλότοι τείνουν να έχουν αρκετά χαμηλούς αρχικούς μισθούς και συνήθως λειτουργούν ως πρώτοι αξιωματικοί και όχι ως καπετάνιοι. Μετά από ένα σημαντικό ποσό αρχαιότητας όπως έχει δημιουργηθεί, ένας καπετάνιος μπορεί να κάνει τέσσερις έως οκτώ φορές περισσότερο από την αρχική του αμοιβή. Η αρχαιότητα δεν είναι συνήθως το ίδιο πράγμα με την εμπειρία, καθώς αναφέρεται μόνο στο χρονικό διάστημα που αφιερώνεται σε μια συγκεκριμένη εταιρεία. Αυτό σημαίνει ότι ο μισθός ενός εμπορικού πιλότου θα υποφέρει συνήθως εάν πρέπει να βρει δουλειά με μια νέα εταιρεία, ακόμη και αν έχει πολυετή εμπειρία, αν και και οι δύο παράγοντες επηρεάζουν σίγουρα τους βαθμούς αμοιβής.
Ο μισθός ενός εμπορικού πιλότου μπορεί επίσης να εξαρτάται από τη βιομηχανία στην οποία εργάζεται. Ορισμένες βιομηχανίες πληρώνουν καλύτερα από άλλες και ορισμένες μεμονωμένες εταιρείες έχουν επίσης σημαντικά υψηλότερα ή χαμηλότερα επίπεδα αμοιβής. Οι εμπορικοί πιλότοι που εργάζονται για επιβατικές αεροπορικές εταιρείες τείνουν να κάνουν λιγότερους από αυτούς που εργάζονται για αεροπορικές εταιρείες φορτίου, αν και υπάρχουν εξαιρέσεις. Υπάρχουν επίσης πολλές άλλες βιομηχανίες που απασχολούν εμπορικούς πιλότους, όπως ιδιωτικές εταιρείες ναυλωμένων αερομεταφορών και ιατρικές υπηρεσίες μεταφορών, καθεμία από τις οποίες έχει τις δικές της ανεξάρτητες κλίμακες αμοιβών.