Αν και δεν υπάρχει αλάνθαστος τρόπος για να αποφευχθεί εντελώς η τροφική δηλητηρίαση από οστρακοειδή, υπάρχουν βήματα που πρέπει να ληφθούν για να γίνει η κατανάλωση σχετικά ασφαλής. Η τροφική δηλητηρίαση από οστρακοειδή συμβαίνει συχνότερα όταν καταναλώνονται οστρακοειδή από νερό που μπορεί να έχουν μολυνθεί από κόκκινες παλίρροιες ή που έχουν πρόσφατα μολυνθεί. Η εμπορική βιομηχανία οστρακοειδών υπόκειται σε ρύθμιση και οι λειτουργίες επιθεωρούνται τακτικά, καθιστώντας τα περισσότερα εμπορικά παρασκευασμένα οστρακοειδή ασφαλή για κατανάλωση. Οι περισσότερες τροφικές δηλητηριάσεις από οστρακοειδή συμβαίνουν όταν ερασιτέχνες συλλέγουν και τρώνε μολυσμένα οστρακοειδή. Είναι επίσης επικίνδυνο να τρώτε ωμά ή κακοψημένα οστρακοειδή.
Όπως κάθε άλλο τρόφιμο, τα οστρακοειδή μπορούν να μολυνθούν με βακτήρια και επιβλαβείς μικροοργανισμούς μέσω ακατάλληλου χειρισμού. Τα οστρακοειδή πρέπει πάντα να προέρχονται από αξιόπιστες πηγές. Μην τρώτε ποτέ οστρακοειδή εάν δεν είστε σίγουροι για την πηγή. Οποιαδήποτε θαλασσινά πρέπει να παρασκευάζονται με πλυμένα χέρια και καθαρά σκεύη και σε καθαρό χώρο εργασίας. Το σχολαστικό μαγείρεμα των οστρακοειδών θα σκοτώσει πολλούς επιβλαβείς μικροοργανισμούς.
Μερικές φορές τα οστρακοειδή μπορεί να περιέχουν τοξίνες που είναι σταθερές στη θερμότητα και δεν μπορούν να αφαιρεθούν με το μαγείρεμα. Είναι καλύτερο να αποφεύγετε την κατανάλωση οστρακοειδών κατά τους ζεστούς καλοκαιρινούς μήνες, ειδικά εάν οι κόκκινες παλίρροιες ήταν έντονες. Κατά τη διάρκεια μιας κόκκινης παλίρροιας, οι πληθυσμοί του φυτοπλαγκτού γίνονται τόσο πολυάριθμοι που το σώμα τους κάνει το νερό να φαίνεται κοκκινωπό. Παράγονται φυσικές τοξίνες που μπορούν να προσληφθούν από τα οστρακοειδή. Καθώς τα οστρακοειδή είναι τροφοδότες φίλτρων, το σώμα τους μπορεί να συσσωρεύσει τοξίνες και να προκαλέσει ασθένειες σε ανθρώπους ή ζώα που τα τρώνε.
Τροφική δηλητηρίαση από οστρακοειδή μπορεί επίσης να συμβεί όταν τα οστρακοειδή είναι μολυσμένα με ιούς ηπατίτιδας Α ή Norwalk. Επιπλέον, υπάρχουν τέσσερις αναγνωρισμένοι τύποι δηλητηρίασης από οστρακοειδή από τη συσσώρευση φυσικών τοξινών. Η αμνησία και η νευροτοξική δηλητηρίαση από οστρακοειδή μπορεί να προκαλέσει ασθένεια, αλλά δεν υπάρχουν γνωστοί θάνατοι. Ένα ξέσπασμα της δηλητηρίασης από οστρακοειδή το 1987 στον ανατολικό Καναδά είχε ποσοστό θνησιμότητας 3 τοις εκατό. Η δηλητηρίαση από παραλυτικά οστρακοειδή είναι η πιο θανατηφόρα, με ποσοστό θνησιμότητας από 1 έως 12 τοις εκατό.
Ορισμένοι πληθυσμοί διατρέχουν αυξημένο κίνδυνο τροφικής δηλητηρίασης από οστρακοειδή. Αυτά περιλαμβάνουν παιδιά και ηλικιωμένους, ειδικά εάν έχουν μειωμένο ανοσοποιητικό σύστημα. Οι περισσότερες περιπτώσεις δηλητηρίασης από οστρακοειδή υποχωρούν από μόνες τους, αλλά θα πρέπει να αναζητηθεί ιατρική βοήθεια εάν υπάρχει υποψία τροφικής δηλητηρίασης από οστρακοειδή. Τα συμπτώματα από ορισμένους τύπους δηλητηρίασης μπορεί να εμφανιστούν μέσα σε λίγα λεπτά από την κατανάλωση οστρακοειδών και περιλαμβάνουν μυρμήγκιασμα ή κάψιμο των χειλιών και της γλώσσας, ναυτία και κοιλιακό άλγος. Άλλοι τύποι δηλητηρίασης από οστρακοειδή, όπως η ηπατίτιδα Α, μπορεί να χρειαστούν αρκετές εβδομάδες για να εμφανιστούν τα συμπτώματα.
Παρόλο που η συχνότητα εμφάνισης της κόκκινης παλίρροιας συνεχίζει να αυξάνεται, είναι σημαντικό να θυμάστε ότι η περισσότερη κατανάλωση οστρακοειδών είναι απολύτως ασφαλής. Καθώς τα οστρακοειδή που παράγονται στο εμπόριο υπόκεινται σε αυστηρούς κανονισμούς σχετικά με τις πρακτικές, το κοινό συνεχίζει να απολαμβάνει τα οστρακοειδή χωρίς υπερβολική ανησυχία. Γενικά, τα διατροφικά οφέλη από την κατανάλωση οστρακοειδών τείνουν να αντισταθμίζουν κάθε κίνδυνο δηλητηρίασης, ειδικά εάν τα οστρακοειδή προέρχονται από το εμπόριο και μαγειρεύονται καλά.