Η ναπολιτάνικη πίτσα θεωρείται η πιο αυθεντική από όλα τα είδη ιταλικής πίτσας. Βασισμένη σε συνταγές που αναπτύχθηκαν τον 19ο αιώνα, η ναπολιτάνικη πίτσα μπορεί να παρασκευαστεί μόνο με συστατικά που καλλιεργούνται και συγκομίζονται στην Ιταλία, όπως ντομάτες San Marzano και αλεύρι που αλέθεται από ολικό σιτάρι. Σε αντίθεση με τις αμερικανοποιημένες εκδόσεις της ιταλικής πίτσας, μια πραγματικά αυθεντική πίτσα αυτού του τύπου ψήνεται μόνο για μικρό χρονικό διάστημα σε πολύ ζεστό φούρνο.
Η προετοιμασία της ναπολιτάνικης ζύμης πίτσας είναι η βάση για τη δημιουργία μιας πίτσας αυθεντικά ναπολιτάνικης φύσης. Μόνο αλεσμένο αλεύρι σίτου που θεωρείται ότι έχει υψηλή περιεκτικότητα σε πρωτεΐνη μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη δημιουργία της κρούστας. Μαγιά μπύρας, μικρή ποσότητα αλατιού και νερό είναι τα μόνα άλλα συστατικά.
Μια κρούστα ναπολιτάνικης πίτσας ζυμώνεται ιδανικά με το χέρι, αν και ορισμένες πηγές λένε ότι η χρήση ενός μίξερ χαμηλής ταχύτητας θα δώσει το επιθυμητό αποτέλεσμα. Αφού ζυμωθεί καλά η ζύμη, απλώνεται σε αλευρωμένη επιφάνεια και γίνεται μια λεπτή κρούστα. Είναι σημαντικό για το τελικό προϊόν η κρούστα να μην είναι παχύτερη από 0.12 ίντσες (3 mm), εάν η συνταγή της ναπολιτάνικης ζύμης πίτσας πρόκειται να μαγειρευτεί σωστά.
Μόλις ετοιμαστεί η κρούστα, οι ντομάτες κόβονται σε κύβους και πιέζονται για να δημιουργηθεί μια σάλτσα μαρινάρας που έχει τη σωστή σύσταση. Αφού αλείψουμε την κρούστα με μια λεπτή μεμβράνη ελαιόλαδου, οι ντομάτες τοποθετούνται στην κορυφή της κρούστας. Τριμμένο τυρί μοτσαρέλα που έχει αφεθεί να στεγνώσει προστίθεται στη συνέχεια πάνω από τις θρυμματισμένες ντομάτες και η πίτσα τοποθετείται σε φούρνο με πέτρα που έχει προθερμανθεί στους 485 βαθμούς Κελσίου (905 βαθμούς Φαρενάιτ). Η πίτσα επιτρέπεται να μείνει στο φούρνο μόνο για ένα λεπτό έως ενάμιση λεπτό. Αυτός είναι αρκετός χρόνος για να γίνει η κρούστα χρυσοκάστανη και τραγανή και να λιώσει τέλεια το τυρί μοτσαρέλα.
Υπάρχουν παραλλαγές σε αυτή τη βασική συνταγή ναπολιτάνικης πίτσας. Μερικοί ζητούν να πιέσετε ψιλοκομμένα κομμάτια σκόρδου στη ζύμη πριν το ψήσιμο. Άλλοι προσθέτουν στη ζύμη ψιλοκομμένο φρέσκο βασιλικό κατά τη διαδικασία του ζυμώματος, ενώ άλλοι χρησιμοποιούν τον βασιλικό πάνω από το τυρί μοτσαρέλα. Εάν δεν υπάρχει διαθέσιμος φούρνος με πέτρα, η χρήση μιας πέτρας πίτσας σε φούρνο αερίου ή ηλεκτρικού θα έχει παρόμοια αποτελέσματα, αν και η θερμοκρασία ψησίματος είναι συνήθως χαμηλότερη και ο χρόνος ψησίματος είναι έως και δέκα λεπτά. Ενώ ορισμένοι θα αμφισβητούσαν εάν αυτές οι καινοτομίες είναι πραγματικά παραδείγματα αυθεντικής ναπολιτάνικης πίτσας, έχουν γίνει αποδεκτές από πολλές πλευρές.