Οι διαβητικοί, που κάνουν δίαιτα και άλλα άτομα με δυσανεξία στη ζάχαρη δεν χρειάζεται να θεσπίσουν μια πλήρη απαγόρευση του φοντάν, απλώς μια απαγόρευση του είδους που περιέχει ζάχαρη. Ένα φοντάν χωρίς ζάχαρη, σε μια σειρά από γεύσεις, μπορεί να προσφέρει την ίδια πυκνή υφή και γλυκύτητα. Υπάρχουν πολλές απλές συνταγές. Μερικοί χρησιμοποιούν φυσικά γλυκαντικά όπως σάλτσα μήλου, φυστικοβούτυρο ή κρέμα γάλακτος για να γλυκάνουν διακριτικά τη σοκολάτα. Άλλοι φέρνουν στο μείγμα συστατικά όπως τυρί κρέμα ή πουτίγκα χωρίς ζάχαρη.
Το παραδοσιακό φοντάν απλά δεν θα κάνει για όσους πρέπει να αποφεύγουν τροφές με υψηλή περιεκτικότητα σε απλά σάκχαρα. Σύμφωνα με μια συνταγή για ίσιο φοντάν σοκολάτας από την σεφ του Food Network Anne Thornton, δεν χρειάζονται μόνο 3 φλιτζάνια (περίπου 360 γραμμάρια) ημίγλυκα και τσιπς σοκολάτας γάλακτος, αλλά και ένα κουτί ζαχαρούχο γάλα. Τα απλά σάκχαρα σε αυτή την παρτίδα φοντάν κανονικού μεγέθους δημιουργούν έναν εφιάλτη ενός διαβητικού γεμάτου θερμίδες.
Το φοντάν χωρίς ζάχαρη προσφέρει μια εναλλακτική λύση, όπως και πολλές συνταγές με χαμηλή περιεκτικότητα σε ζάχαρη. Αντί για ημίγλυκα ή τσιπς σοκολάτας γάλακτος, χρησιμοποιείται μια ποικιλία χωρίς ζάχαρη. Ένα δημοφιλές στυλ ονομάζεται χαρούπι, το οποίο γλυκαίνεται με βυνοποιημένο κριθάρι. Για να φέρουν τη γλυκύτητα και την υφή στα πρότυπα του φοντάν, πολλοί προσθέτουν επίσης συστατικά όπως φυστικοβούτυρο, σταφίδες, σάλτσα μήλου ή τυρί κρέμα. Τα τεχνητά γλυκαντικά είναι ένα άλλο συστατικό που συνήθως προστίθεται για να αντισταθμίσει το κενό της κρυσταλλικής ζάχαρης.
Μια συνταγή για φοντάν χωρίς ζάχαρη στον γαστρονομικό ιστότοπο CD Kitchen, λιώνει τη σοκολάτα χωρίς ζάχαρη με λίγα μόνο πακέτα τυρί κρέμα, θρυμματισμένα καρύδια, τεχνητό γλυκαντικό και εκχύλισμα βανίλιας και στη συνέχεια τη χτυπάει μέχρι να χτυπηθεί και να είναι έτοιμη να χυθεί και να κρυώσει. Άλλες συνταγές χρησιμοποιούν εντελώς διαφορετικά συστατικά για να αντικαταστήσουν τα απλά σάκχαρα. Μια συνταγή για φοντάν χωρίς ζάχαρη, επίσης στον γαστρονομικό ιστότοπο του CD Kitchen, γλυκαίνει τη σοκολάτα χωρίς ζάχαρη με σάλτσα μήλου χωρίς ζάχαρη, θρυμματισμένα κράκερ Graham, γάλα χωρίς λιπαρά, ψεύτικη ζάχαρη και ψιλοκομμένες σταφίδες. Οποιαδήποτε συνταγή είναι γεμάτη με φυσικά γλυκά και υγιεινά συστατικά.
Τα περισσότερα φοντάν χωρίς ζάχαρη θα ακολουθήσουν την ίδια βασική διαδικασία. Όλα βράζονται και χτυπιούνται ελαφρά μέχρι να χυθούν σαν παχύρρευστο υγρό σε ταψιά με επένδυση από κερί. Στη συνέχεια, το φοντάν κάθεται καλυμμένο στο ψυγείο μέχρι να μπορέσει να κοπεί, με ίσως κάποια προσπάθεια, σε τετράγωνα. Πολλά είδη αποξηραμένων φρούτων ή ξηρών καρπών μπορούν να αναμειχθούν σε όλο το φοντάν για πρόσθετο ενδιαφέρον. Αυτά τα συστατικά μπορούν επίσης να απλωθούν πάνω από το φοντάν αμέσως μετά την έκχυση, αλλά προτού αρχίσει να σκληραίνει το πάνω μέρος ή τα συστατικά δεν κολλήσουν στο επάνω στρώμα του φοντάν.